中國教育報(bào)-中國教育新聞網(wǎng)訊(記者 程墨 通訊員 尚紫荊 蔣朝常)10月13日,作物遺傳改良全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、湖北洪山實(shí)驗(yàn)室代明球教授、李林教授課題組聯(lián)合湖北洪山實(shí)驗(yàn)室、園藝植物生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李峰教授課題組在國際頂刊《自然生物技術(shù)》(Nature Biotechnology)發(fā)表最新研究成果,詳細(xì)闡述了玉米產(chǎn)量和抗性平衡的遺傳與分子機(jī)制,為玉米高抗高產(chǎn)精準(zhǔn)分子設(shè)計(jì)育種奠定了理論基礎(chǔ)。
玉米是我國種植面積最大、產(chǎn)量最高的糧食作物,對(duì)保障國家糧食安全至關(guān)重要。近百年來,育種家將玉米產(chǎn)量大幅提高,但伴隨而來的是玉米抗旱性的顯著下降,表明產(chǎn)量性狀和抗逆性狀往往相互拮抗。揭示其遺傳與分子作用機(jī)制,使玉米產(chǎn)量和抗性達(dá)到最佳平衡,是作物育種有重要應(yīng)用價(jià)值的研究課題。
sRNA是一類短片段的非編碼RNA,在真核生物中廣泛存在。sRNA被報(bào)道對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫應(yīng)答起到重要的調(diào)控作用。植物基因組上普遍存在一類反向重復(fù)結(jié)構(gòu)IR(Inverted repeat),能夠產(chǎn)生大量的sRNA。盡管知道這些IR產(chǎn)生的sRNA能夠在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá),但I(xiàn)R是否及如何通過產(chǎn)生sRNA調(diào)控基因的表達(dá)進(jìn)而控制玉米產(chǎn)量和環(huán)境脅迫耐受性迄今未知。
通過高通量測(cè)序,研究團(tuán)隊(duì)獲得了338份玉米關(guān)聯(lián)群體在正常澆水(WW)和干旱脅迫(DS)生長(zhǎng)條件下的sRNA表達(dá)組和其中197份群體的轉(zhuǎn)錄組。從中檢測(cè)到三萬多個(gè)響應(yīng)干旱脅迫的sRNA并獲得其群體水平的表達(dá)性狀。對(duì)上述sRNA表達(dá)性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(eGWAS),共獲得6000來個(gè)調(diào)控sRNA表達(dá)的eQTL(大部分為IR結(jié)構(gòu)變異),其中有29個(gè)是eQTL熱點(diǎn),能同時(shí)調(diào)控20個(gè)以上sRNA的表達(dá)。
通過預(yù)測(cè)分析,團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)29個(gè)eQTL熱點(diǎn)所產(chǎn)生的sRNA調(diào)控2764個(gè)潛在的靶基因。其中,530個(gè)基因(19.2%)與植物繁殖相關(guān),891個(gè)基因(32.2%)與脅迫應(yīng)答相關(guān),表明這些seQTL熱點(diǎn)在調(diào)控玉米產(chǎn)量和環(huán)境適應(yīng)性方面發(fā)揮重要功能。為了進(jìn)一步解析作物產(chǎn)量和環(huán)境適應(yīng)性分子調(diào)控機(jī)制,作者克隆了8號(hào)染色體上一個(gè)干旱特異性超級(jí)熱點(diǎn)eQTL DRESH8,DRESH8與上千個(gè)sRNA表達(dá)相關(guān)。
他們發(fā)現(xiàn),群體中,缺乏DRESH8的玉米在干旱脅迫下的存活率高于攜帶DRESH8的玉米,就產(chǎn)量性狀而言(如穗長(zhǎng)、穗直徑、粒長(zhǎng)、粒寬、粒厚、百粒重等),含有DRESH8的野生型玉米要比不含DRESH8的基因編輯(類似分子剪刀,能將DRESH8剪除)轉(zhuǎn)基因玉米提高5%-14%,即DRESH8的存在有利于提高玉米產(chǎn)量。以上這些數(shù)據(jù)表明,DRESH8能夠介導(dǎo)耐旱性和產(chǎn)量性狀之間的選擇平衡,進(jìn)而影響玉米在世界范圍內(nèi)的傳播。
為了更全面地描述IR在玉米響應(yīng)干旱中的普遍作用,團(tuán)隊(duì)研究了全基因組范圍內(nèi)的IR結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)了大量與干旱適應(yīng)性和產(chǎn)量性狀相關(guān)的環(huán)境特異性遺傳調(diào)控因子。由IR結(jié)構(gòu)介導(dǎo)的產(chǎn)量抗性平衡機(jī)制,為通過基因組精準(zhǔn)設(shè)計(jì)來培育高抗高產(chǎn)作物鋪平了道路,提供了優(yōu)異基因資源?!敖酉聛恚覀儗⒔Y(jié)合玉米產(chǎn)量和抗性平衡的遺傳與分子機(jī)制,致力于玉米高抗高產(chǎn)精準(zhǔn)分子設(shè)計(jì)育種研究?!贝髑蛘f。
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